ANALISI GENETICA DELLA BIODIVERSITA'
Anno accademico 2023/2024 - Docente: Giancarlo RAPPAZZORisultati di apprendimento attesi
Modalità di svolgimento dell'insegnamento
Presentazione degli argomenti a partire dai dati sperimentali noti o più rilevanti.
Prerequisiti richiesti
Frequenza lezioni
Contenuti del corso
Testi di riferimento
John Maynard Smith, Evolutionary Genetics, Oxford University Press, 2nd edition, ISBN-10: 0198502311
Articoli tratti dalla letteratura scientifica forniti dal Docente. Informazioni tratte da siti specializzati indicati dal docente o trovati autonomamente dallo studente
Autore | Titolo | Editore | Anno | ISBN |
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John Maynard Smith | Evolutionary Genetics | Oxford University Press | 2nd edition | ISBN-10: 0198502311 |
Richard Frankham, Jonathan D Ballou, David A Briscoe | Fondamenti di genetica della conservazione | Zanichelli | 2006 | ISBN-10: 8808170187 |
Programmazione del corso
Argomenti | Riferimenti testi | |
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1 | Il DNA come materiale genetico. Stabilità chimica e di informazione. Lavorare con il DNA in laboratorio. Enzimi utili e tecniche elettroforetiche. | diapositive |
2 | Le mutazioni: concetto, frequenza, rilevanza biologica ed evoluzionistica. Come si diffondono le mutazioni: selezione, deriva genetica, flusso genico. | diapositive e articoli forniti. |
3 | Le mutazioni puntiformi o SNP: metodi di rilevamento molecolari. PCR e sequenziamento; PCR-RFLP; Aso; Snapshot; NGS. | diapositive |
4 | Associazione fra loci sul cromosoma. I polimorfismi come marcatori genetici; la costruzione di mappe genetiche e mappe fisiche (cenni). | diapositive |
5 | Polimorfismi, aplotipi, linkage equilibrium e linkage disequilibrium. Il cromosoma come patchwork. Ricostruzione dell'evoluzione umana dai dati genetici. | diapositive |
6 | I database di sequenze biomolecolari. Metodi bioinformatici di consultazione dei database: le query Blast. L'allineamento fra due o più sequenze e relative valutazioni: indici utili. | diapositive |
7 | La teori neutralista e l'orologio molecolare. Loci slow evolving e loci fast evolving nell'analisi evoluzionistica. | diapositive e articoli scientifici |
8 | Ricostruzione filogenetica: allineamento multiplo, matrice di distanze genetiche, algoritmi relativi a modelli evoluzionistici distinti (NJ, UPGMA, ME, parsimonia). Esempi pratici | diapositive e articoli scientifici |
9 | Il BarCoding e l'analisi della biodiversità: i loci più comuni e le relative applicazioni in problemi biologici. | diapositive e articoli scientifici |
10 | Una fonte di variabilità inaspettata: l'imprinting genomico nello sviluppo e nel differenziamento. | diapositive e articoli scientifici |
11 | Differenze fra animali e piante dal punto di vista della genetica | diapositive e articoli scientifici |
Verifica dell'apprendimento
Modalità di verifica dell'apprendimento
Esempi di domande e/o esercizi frequenti
Discussione dei risultati
Analisi dei dati