GENETICA MOLECOLARE E BIOTECNOLOGIE MICROBICHEModulo BIOTECNOLOGIE MICROBICHE
Anno accademico 2023/2024 - Docente: Maria Carmela SANTAGATIRisultati di apprendimento attesi
Il modulo di BIOTECNOLOGIE MICROBICHE si propone di ampliare ed
approfondire le conoscenze di genomica microbica rivolgendo particolare
attenzione alla organizzazione genica (whole genome sequencing, uso di database genomici e tools
bioinformatici per l’analisi dei dati), alla trascrittomica, al ruolo di
elementi genetici mobili, alle modalità di trasferimento genico orizzontale ed
alle tecniche di DNA ricombinante indirizzate anche ad una sua applicazione in
ambito biotecnologico. Nel corso inoltre, vengono approfondite le conoscenze
sul microbiota/microbioma umano con analisi metagenomica e sulla
caratterizzazione di ceppi batterici con caratteristiche probiotiche produttori
di batteriocine. Seguendo il corso gli studenti maturano inoltre, una
comprensione integrata dei fenomeni biologici e una preparazione scientifica
avanzata a livello morfologico/funzionale, cellulare/molecolare dei microrganismi
Modalità di svolgimento dell'insegnamento
Lezioni frontali, tutorato, esercitazioni e seminari.
Qualora l'insegnamento venisse impartito in modalità mista o a distanza potranno essere introdotte le necessarie variazioni rispetto a quanto dichiarato in precedenza, al fine di rispettare il programma previsto e riportato nel syllabus.
Prerequisiti richiesti
microbiologia e genetica
Frequenza lezioni
Contenuti del corso
Genomi microbici, analisi del genoma batterico e caratterizzazione di elementi genici mobili ( trasposoni e plasmidi). Principi di DNA sequencing, mutagenesi, PCR, progettazione di primers, Real-Time PCR indirizzati allo studio della genetica batterica. Uso di tools bioinformatici per l'analisi di dati ottenuti dal sequenziomento di microrganismi. Studio dei sistemi CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) e sue applicazioni. Applicazione della diagnostica molecolare ( DNA ed immunologica, anticorpi monoclonali). Probiotici, batterioterapia e loro applicazioni, analisi di microbiomi. Studio dei sistemi toxin e antitoxin ( TA), sRNA e riboswitch.
Testi di riferimento
- Biologia dei microrganismi, Gianni Deho, Enrica Galli
- Molecular Genetics of Bacteria- Jeremy Dale Editor John Wiley and Sons
- articoli scientifici
- diapositive lezioni
Programmazione del corso
| Argomenti | Riferimenti testi | |
|---|---|---|
| 1 | Sequenziamento ed analisi del genoma batterico ( DNA sequencing; analisi di sequenza, uso di tools bioinformatici, whole genome sequencing). | |
| 2 | Studi di genomica indirizzati allo studio dei nuovi target identificativi in diagnostica molecolare ( PCR e progettazione di primers, Real-Time PCR) | |
| 3 | caratterizzazione di elementi genici mobili ( trasposoni e plasmidi), trasferimento genico orizzontale, applicazione in ambito biotecnologico | |
| 4 | Studio dei sistemi CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) e sue applicazionii | |
| 5 | Strategie di mutagenesi sito specifica indirizzati allo studio della genomica batterica | |
| 6 | Bersagli e saggi per scoprire nuovi agenti antibatterici: sistemi Toxin–antitoxin (TA) systems , sRNA, riboswitch | |
| 7 | Microbiomi, Probiotici e loro applicazioni in batterioterapia |
Verifica dell'apprendimento
Modalità di verifica dell'apprendimento
Colloquio orale.
La verifica dell’apprendimento potrà essere effettuata anche per via telematica, qualora le condizioni lo dovessero richiedere.
Informazioni per studenti con disabilità e/o DSA
A garanzia di pari opportunità e nel rispetto delle leggi vigenti, gli studenti interessati possono chiedere un colloquio personale in modo da programmare eventuali misure compensative e/o dispensative, in base agli obiettivi didattici ed alle specifiche esigenze. E' possibile rivolgersi anche al referente CInAP (Centro per l’integrazione Attiva e Partecipata - Servizi per le Disabilità e/o i DSA) del Dipartimento di Scienze Biomediche e Biotecnologiche.
Esempi di domande e/o esercizi frequenti
cosa si intente come microbioma e microbiota