DIAGNOSTICA BATTERIOLOGICA E ANTIBIOTICO SENSIBILITA'

Conoscenza e comprensione
Al termine del corso lo studente avrà acquisito conoscenze relative ai principali microrganismi patogeni di interesse clinico e ai principi della diagnostica batteriologica. Conoscerà le principali fasi del percorso diagnostico microbiologico, dalla raccolta e gestione del campione biologico all’esame microscopico e colturale, fino all’identificazione fenotipica e molecolare dei microrganismi. Avrà inoltre acquisito conoscenze sui principi e sui principali metodi per la valutazione della sensibilità agli antibiotici e sui criteri interpretativi dell’antibiogramma.

Capacità di applicare conoscenza e comprensione
Al termine del corso lo studente sarà in grado di applicare le conoscenze acquisite alla gestione delle principali fasi della diagnostica batteriologica, riconoscendo l’approccio metodologico più appropriato in relazione al campione biologico e al microrganismo ricercato. Sarà inoltre in grado di comprendere e interpretare i risultati dei principali test di identificazione batterica e dei test di sensibilità agli antibiotici e di inquadrarli nel contesto di semplici casi diagnostici.

L’insegnamento prevede lezioni frontali, attività pratiche di laboratorio e attività di approfondimento individuale.

Le lezioni frontali sono finalizzate all’acquisizione delle conoscenze teoriche relative ai principi della diagnostica batteriologica, alle principali metodiche di identificazione dei microrganismi, alla diagnostica molecolare, alla valutazione della sensibilità agli antibiotici e ai principali meccanismi di antibiotico-resistenza.

Una parte rilevante dell’attività didattica è svolta in laboratorio con il supporto di un tutor del settore, al fine di consentire agli studenti di acquisire familiarità con le principali fasi del percorso diagnostico batteriologico e con le metodiche affrontate durante le lezioni teoriche. Le attività pratiche sono finalizzate a favorire l’applicazione delle conoscenze acquisite e la comprensione critica dei risultati ottenuti.

Durante il corso, a ciascuno studente viene inoltre assegnato uno specifico microrganismo da approfondire individualmente. Lo studente prepara una presentazione PowerPoint che viene successivamente presentata e discussa. Tale attività è finalizzata a sviluppare la capacità di ricerca e selezione delle informazioni scientifiche, l’autonomia nell’approfondimento e le capacità di comunicazione scientifica.

Le diverse modalità didattiche concorrono pertanto in maniera integrata al raggiungimento dei risultati di apprendimento previsti dall’insegnamento, combinando l’acquisizione delle conoscenze teoriche con la loro applicazione in ambito laboratoristico e diagnostico.

Qualora l’insegnamento venisse impartito in modalità mista o a distanza potranno essere introdotte le necessarie variazioni rispetto a quanto sopra dichiarato, al fine di rispettare il programma previsto e riportato nel presente syllabus.

Prerequisiti curriculari
Non sono previsti specifici prerequisiti curriculari, salvo eventuali propedeuticità stabilite dal Regolamento didattico del Corso di Studio.

Prerequisiti culturali
È importante possedere conoscenze di base di microbiologia generale, con particolare riferimento alla struttura, fisiologia, crescita e genetica dei microrganismi, nonché conoscenze di base di biochimica e biologia molecolare. Tali conoscenze sono necessarie per comprendere i principi e le metodologie della diagnostica batteriologica e dello studio della sensibilità agli antibiotici.

Considerata la natura teorico-pratica dell’insegnamento e la presenza di attività di laboratorio, la partecipazione alle attività didattiche è necessaria per il raggiungimento dei risultati di apprendimento previsti.

Per le attività di laboratorio, il numero di studenti ammessi può essere limitato in relazione alla disponibilità degli spazi, delle attrezzature e alle esigenze organizzative e di sicurezza.

Principi di diagnostica batteriologica
Introduzione alla diagnostica microbiologica e al percorso diagnostico batteriologico. Diagnosi diretta. Fase preanalitica: raccolta, conservazione, trasporto e gestione del campione biologico.

Esame microscopico e colturale
Esame batterioscopico diretto e principali tecniche di colorazione. Principi dell’esame colturale. Isolamento dei microrganismi e valutazione delle caratteristiche macroscopiche delle colture. Approccio diagnostico ai principali campioni clinici: sangue, liquor, urine, feci, campioni respiratori e tamponi.

Identificazione dei microrganismi
Principi e metodi per l’identificazione batterica. Valutazione delle caratteristiche fisiologiche e metaboliche. Metodi biochimici e sistemi di identificazione. Principi della diagnostica immunologica. Cenni ai sistemi automatizzati e alle metodiche di identificazione rapida.

Diagnostica molecolare
Principi dell’identificazione dei microrganismi su base genotipica. Estrazione e purificazione degli acidi nucleici. Principi e applicazioni della PCR nella diagnostica batteriologica. Identificazione mediante analisi del gene 16S rRNA. Principi delle tecniche elettroforetiche applicate all’analisi degli acidi nucleici e degli amplificati di PCR.

Valutazione della sensibilità agli antibiotici – Antimicrobial Susceptibility Testing (AST)
Principi della valutazione della sensibilità agli antibiotici. MIC e MBC. Metodi di diffusione, diluizione e gradient diffusion. Principi di esecuzione dell’antibiogramma. Interpretazione dei risultati dei test di sensibilità agli antibiotici e criteri interpretativi EUCAST; cenni ai criteri CLSI.

Antibiotico-resistenza
Principali meccanismi di resistenza agli antibiotici e loro rilevanza nella diagnostica microbiologica. Metodi fenotipici e molecolari per la rilevazione dei principali meccanismi di resistenza. Ricerca mediante PCR di determinanti genetici associati all’antibiotico-resistenza.

Applicazioni alla diagnostica batteriologica
Principali batteri patogeni di interesse clinico. Integrazione delle diverse fasi del percorso diagnostico attraverso esempi e semplici casi applicativi: urinocoltura, diagnostica delle infezioni respiratorie e faringee, emocoltura e diagnostica delle infezioni del sistema nervoso centrale.

Testi e materiale didattico di riferimento

1. Sherris – Microbiologia Medica, ultima edizione disponibile, EMSI.
2. Murray, Rosenthal, Pfaller – Microbiologia Medica, ultima edizione disponibile, Edra.
3. Materiale didattico, protocolli e dispense forniti dal docente e resi disponibili sulla piattaforma didattica.

Materiale di approfondimento

4. EUCAST – European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Documenti e linee guida aggiornati relativi all’Antimicrobial Susceptibility Testing (AST), inclusi breakpoint clinici e documenti metodologici.
5. Articoli scientifici e materiale bibliografico selezionato dal docente per gli approfondimenti relativi alla diagnostica batteriologica, all’antibiotico-resistenza e ai microrganismi assegnati agli studenti.

La verifica dell’apprendimento avviene mediante colloquio orale finalizzato ad accertare il raggiungimento dei risultati di apprendimento previsti dall’insegnamento.

Durante il colloquio saranno valutate la conoscenza e la comprensione dei principi della diagnostica batteriologica, delle principali metodiche di identificazione dei microrganismi e dei metodi per la valutazione della sensibilità agli antibiotici. Sarà inoltre valutata la capacità dello studente di applicare le conoscenze acquisite all’interpretazione delle principali fasi del percorso diagnostico microbiologico e di semplici casi applicativi.

Ai fini della valutazione finale saranno considerate la correttezza e completezza delle conoscenze, la pertinenza delle risposte, la capacità di collegare i diversi argomenti del programma, la capacità di applicare le conoscenze a problemi di diagnostica batteriologica e di interpretazione dell’antibiogramma, nonché la proprietà del linguaggio scientifico e tecnico.

La votazione finale è espressa in trentesimi. Il superamento dell’esame richiede il conseguimento di almeno 18/30. La lode può essere attribuita agli studenti che dimostrino conoscenze particolarmente approfondite, elevata capacità di integrazione e applicazione dei contenuti e piena padronanza del linguaggio scientifico.

La verifica dell’apprendimento potrà essere effettuata anche per via telematica, qualora le condizioni lo dovessero richiedere.

A garanzia di pari opportunità e nel rispetto delle leggi vigenti, gli studenti interessati possono chiedere un colloquio personale in modo da programmare eventuali misure compensative e/o dispensative, in base agli obiettivi didattici ed alle specifiche esigenze. È possibile rivolgersi anche al docente referente CInAP del proprio Dipartimento.